Az Európai Unió Duna Régió Stratégia (EUSDR) hazai koordinációjáról és a koordinációhoz szükséges források biztosításáról az 1444/2020 (VII.28.) számú kormányhatározat rendelkezik.
A Kormány tagjainak feladat- és hatásköréről szóló Kormányrendelet 141. § g) pontja alapján az Európai Duna Stratégiával kapcsolatos kormányzati feladatokat a külgazdasági és külügyminiszter koordinálja.
A Külgazdasági és Külügyminisztérium Szervezeti és Működési Szabályzatáról szóló 8/2022. (VI.28.) KKM utasítás alapján a Duna Régió Stratégia mint európai uniós fejlesztési keretrendszer magyar koordinációja felett Bihari Katalin, a külgazdaság fejlesztéséért felelős helyettes államtitkár gyakorol közvetlen politikai felügyeletet.